Начиная с версии 0.19.2 FreeCAD перешёл на устновку через flatpak.
Сначала нужно установить FreeCAD и сопутствующие пакеты командой:
flatpak install flathub org.freecadweb.FreeCAD
И FreeCAD появляется в системном меню в разделе графики.
Или можно запустить из командной строки:
flatpak run org.freecadweb.FreeCAD